随着应急指挥系统在安防行业的应用越来越广泛，其对突发事件的快速响应、辅助调度、监督执行等综合价值毋庸置疑，但现有平台体系的不足之处也逐渐显现。目前，应急指挥系统存在的问题主要体现在资源优化整合、信息传输、综合平台建设等方面。
数据整合与传输优化难点
由于安全应急数据范围广应急指挥系统，具有跨行业、跨领域、分散分布的特点，数据难以聚合和整合。面对紧急事件，关键信息难以快速检索，影响决策速度。在海量数据的存储和传输过程中，要保证数据的安全性、快速传输以及图像质量的损失也是极其困难的。以地震灾害应急指挥为例，地震多发地区通常会出现交通拥堵和通讯中断的情况。使用传统的视频图像传输技术，容易出现传输速度慢、画质失真、甚至传输中断、数据丢失、信息孤岛等问题。当自然灾害发生时，灾区与救援信息的双向沟通极为重要。它是救援人员制定救援路线、运输方式、物资准备、医疗建设等救援方案的事实依据，在很大程度上决定了救援的成效。因此，在应急指挥系统平台建设中，数据的安全存储和快速传输需要依靠更先进的视频信息技术和网络传输技术。
综合应用平台体系建设不足
在应急指挥平台的一体化建设方面，还缺乏高度综合性的体系结构，各层次、各系统、各模块的集成并不简单顺畅，不能完全融入全流程突发事件应急指挥调度工作。以公安行业为例，传统的烟囱式分级指挥模式已经不能满足复杂的警务工作，系统对可视化、扁平化、集成化的要求越来越迫切。在实际应用中，应急指挥平台需要整合视频会议、移动警务装备等更多系统和资源，从而直接部署一线警力，减少冗余流程，
